В статье обоснованы методологические подходы к стратегическому пространственному планированию прибрежных агломераций и сельских населённых пунктов, подверженных совместному воздействию климатической трансгрессии и антропогенного проседания земной поверхности (субсиденции). На основе сценариев CMIP6 (SSP1-2.6, SSP2-4.5, SSP5-8.5), цифровой модели рельефа и гидродинамического моделирования штормовых нагонов выполнена вероятностная оценка границ зон затопления с учётом межмодельной неопределённости. Предложена трёхступенчатая дифференциация прибрежной территории по периодам повторяемости подтопления, служащая основой для установления красных линий застройки и нормативных ограничений капитального строительства. Рассмотрены стратегии инженерной защиты, приспособления застройки и планового отступления применительно к поселениям различной плотности и функционального профиля. Обоснована роль плавневых комплексов, приморских дюн, солончаков в снижении нагрузки на защитные сооружения. Показано, что адаптация прибрежных территорий требует перехода от статичного функционального зонирования к модели с периодическим пересмотром планировочных ограничений по мере уточнения климатических проекций. Результаты применимы при разработке генеральных планов и схем территориального планирования прибрежных муниципальных образований.